Le molecole sono state disegnate utilizzando il freeware ACD Chemsketch 12, seguito dall'ottimizzazione dell'energia con il campo di forza MMFF94 utilizzando TINKER. I pdb delle proteine sono stati scaricati da Protein databank (www.rcsb.org). Le proteine sono state prima sottoposte alla minimizzazione dell'energia, alla protonazione e poi all'identificazione del sito. Il recettore e i candidati farmaci sono stati ottimizzati prima del docking vero e proprio, seguito dal docking in MOE 2012.10 utilizzando la procedura standard indicata nel manuale del software. Le molecole sono state agganciate al sito attivo utilizzando il "campo di forza" come tecnica di raffinamento con le impostazioni predefinite in MOE 2012.10. Tutte le molecole di nuova sintesi sono state agganciate al sito attivo. Tutte le molecole di nuova sintesi sono state agganciate nel sito attivo di AChE (pdb- 1GQR, risoluzione ai raggi X = 2,20 Ao). Per la presente analisi è stata utilizzata l'enoil acil carrier protein reduttasi (InhA) di M. tuberculosis che catalizza la riduzione NADH-specifica del 2-trans-enoil-ACP (pdb: 2H7M, risoluzione = 1,62Å). Per comodità e a scopo di confronto, a titolo rappresentativo, riportiamo le pose di docking per il composto attivo di ciascuna serie.

O Professor Asaraf Ali Mohamed Kassim obteve o seu Bacharelato em Engenharia com distinção de Primeira Classe e Mestrado em Engenharia Electrotécnica pela NUS, e o seu doutoramento pela Carnegie Mellon University. Antes de se juntar à NUS, Ashraf esteve envolvido em investigação de visão mecânica na Texas Instruments.